处理完皇宫内的事情，齐王作为监国亲王，奉旨连续进行了三次朝会，主要讨论了以下几个议题：一是马上成立一个以太医院为主导的，集合所有名医，包括广泛吸纳民间医学高手，研究编订《医学宝典》若干部，可收录历代积累的医学知识，治疗方案，药物分类等等；同时提议，其后进行的科举考试增加医科，具体考试要求由太医院尽快拿出方案；设立农学专科，由大农司迅速组织编订各类指导农业生产的书册，分发各路府州县，有地方长官负责监督和实施，并作为考核地方官员的一项重要内容；适当时机，要增加农业、工矿业等各行业科考专业的名额，鼓励农工发展。
第二次朝会，主要是根据需要，抓紧利用冬末春初的农闲季节，开始修整各地驿道。因为北方仍在冰冻期间，即日起可在南方，尤其江南地区，一直交州率先开工建设。基本要求是在原有驿道基础上，加快加固，整平道路以及桥梁。各路段有所在路府州县负责实施，并特别强调民夫生活费用等必须全额支付，不允许出现任何欺诈行为，朝廷将派出专员沿路视察。由朝廷拨专款调拨水泥等物资，提供桥梁、驿站等修建和整理工作，又特别强调绝对不允许耽搁农事。
第三次朝会的主要议题是实行新的丁税制度改革，即日开始各路府州县重新丈量核定土地，不分公田、私田，甚至朝廷赏赐给王公大臣的田产，寺观庙宇等占有的土地，朝廷将派出专门人员下到各路府州县核实，如果查处造假者，一律将田产收归朝廷，任何人不得例外。
限制皇宫、王公贵族，以及所有官员和富户占有的丁壮，私俾等数量，停止人口买卖行为；寺观庙宇等不经官府（路府之上）批准，不许擅自收纳脱产信徒。超过三十人的所有宗教场所，必须经过朝廷批准才能继续扩招全职信众。严格限制未经朝廷认可的宗教、结社、集会等活动，一经查出将给与严惩。
合法身份的汉人、南人，在求学、科举考试、官吏任命、农工商等活动中，与蒙古、色目人享有同等地位和权力；杜绝任意杀害，欺凌汉人南人的行为，否则以重罪论处。
以上措施很快在朝会上得到通过，只是有两项内容多少引起了争议：一是种族歧视政策的被取剃，自然是触及了部分贵族的利益，尽管没有强有力的理由反对朝廷的决议，但是却也在背地里没少攻击齐王违背祖宗规矩，忘了自己出身，迟早会被低贱民族同化等等。
另一项遭到了一些抵制的措施是：土地和人口清查的同时，一项新的赋税政策出台了：地丁银制度。其主要内容是，打破旧的丁税为主的征收标准，以土地多少作为收税的主要依据；另外规定，凡是成年男子拒绝服役着，可以用粮食和货币代役，叫代役制，有利于农工商人自由支配生产生活需要，是一个进步措施。但它也触及了大地产者切身利益，所以想办法隐瞒地产和人口，一段时期内，还真被朝廷督察人员查处了数十起典型案例，根据齐王指令，给与严惩之后，此类现象才有所收敛，这是后话。
除了明面上的几项朝议内容，齐王自然是紧锣密鼓地部署了多项内容，比如一纸调令，把马岛的达鲁花赤郭继宗调回了京师，任命为工部侍郎，主持全国范围内的工程建设，城市规划建设等等，尤其是现阶段的驿道整修，桥梁工程建设。而同时马岛行省建立起来，左丘成为了马岛行省第一任总督，也是全国第二个获此殊荣的总督。
成立兵器监，临时在兵部办公，右侍郎别不花担任总监，马上开始了选址建设工作。京师的兵器监首先将所有京畿及其周边的冶炼、制器，船舶制作和维修等收归直属，接下来又根据原材料，或者技术力量等各方面因素需要，开设了多个秘密工场，比如火炮、火枪、强弓硬弩的制作单位，那可是不为外人了解的。
“脱脱，别来无恙吧！”处理完公务，难得有一天空闲时间，齐王专门到了刑部打牢，探视被关押在此地的脱脱等重要囚犯。
“托殿下福，他们对草民还算是人道，并没有难为草民！”脱脱气色倒也可以，说话也出自真诚。
“看刑部搜集的证据，两项罪名似乎是属实的，比如这隐匿财产、私通奸佞之臣，并窃取朝廷秘密军情，提供给奸佞之臣，你觉得是否冤枉？”
“殿下，上面已经有草民亲自画押的证据，至于其他多项指控，恕草民无法满足朝廷了！”
“刑部倒是拿出了处理决定，将你们兄弟流放到蛮荒之地！”齐王看脱脱没有多大惊讶，接着说道：“本王倒是觉得可惜了，因为从过往的为官经历来说，你们可都算得上清正廉洁之辈，政绩也算是不错的，因此本王几次与御史台。刑部等沟通交流，又经过朝仪，跟大臣们解说一通，多数人以为应该给你们一个立功赎罪的机会，不知你是否接受？”
“谢王爷殿下，草民将戴罪立功，不辜负王爷厚爱！”这回的脱脱帖木儿不再故作镇定，马上露出了激动之情，颤抖着声音伏在了地上，向齐王恭敬施礼。齐王点点头说道：“相信经过这些挫折，你已经长了不少阅历，无论做什么官职，都应该更加成熟才对。好好吃点，把身子骨养结实，三两天之内朝廷会有诏令下来的。”
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