接下来，面前这个跟自己长得一模一样的主脑给他讲述了一件可怕的事情——
“在这个世界诞生之前，有一个叫做源的计算机学家，他通过自己的技术创造了这个世界，人类通过上传自己的意识，成为了这个世界当中的一部分。
实际上，这些人他们的身体并不在这里，你所看到的一切都是被虚拟出来的景象而已……
只有回归到现实，他们才能从虚拟世界当中醒过来。
而你，就是那个科学家，你拥有着主脑的最高权限，只有你才能让所有人类回归到现实，否则当这里被破坏的时候，外界的人类也会跟着死去。”
就是这时，正当男主犹豫的时候，他的耳机里面传来了人类指挥官的声音：
“别相信他的话，他已经到了穷途末路了，说这些只是用来蛊惑你的，零！什么虚拟世界，什么人造的虚拟环境，这些都是他的谎言，干掉他。
杀掉主脑，人类才能得到真正意义上的解放。”
小林洋介整个人都被弄糊涂了。
究竟谁说的才是真的？
“真是愚蠢，你得靠你的自我意志来做出判断。”主脑对男主说。
“你杀掉我，能够得到什么呢？真实的世界吗？”
主脑笑着说，“不，你无法得到真实，只有我才能让你退出这个虚拟的世界，而我……需要你让我得到解脱。”
他向着男主伸出手去，“来吧，相信我吧，你是我的主人啊！如果你想回归真实的世界，那么你就相信我，让我带你回去。
然后……当你回到那个真实的时候，请务必要关掉我的电源，我已经不希望用这样的方式存在下去了。”
男主站在原地，犹豫了很久。
“哈哈哈哈……”
主脑狂笑起来，似乎是对男主的愚蠢感到悲哀，又或者是因为自己的【阴谋】没有得逞而发狂。
“我明白了，人类真的是一种无可救药的物种，因为他们之间根本就不会存在信任这件事情，既然如此，那么就让我重新创造一个新的世界吧。”
主脑笑着，从身后拔出了枪。
接下来，进入了一场艰苦卓绝的战斗。
……
小林洋介被打了个猝不及防，很快就被那个主脑操控的复制人给干翻在地。
于是小林洋介第一次进入了BAD Ending
周围的一切都变成了虚无缥缈的无比虚幻的东西。
光线在逐渐变暗。
男主的意识逐渐模糊起来，周围的声音变得朦胧……
整个屏幕黑暗。
黑色的屏幕上，出现了一行字：
【人类在第四次机械战争之中失败，最后覆灭，而主脑重新创造了一个新的世界。
也许在这个世界当中，会诞生新的人类。
但他们可能跟以前的人类会有所不同。】
字幕过后。
画面重新亮了起来。
一个少年站在山巅之上，眺望着远方。
远处绿水青山，天空中一轮红彤彤的太阳照亮了一切。
就在这个时候，一只翠绿色的小鸟从树梢上面飞了下来，停留在少年的指尖。
镜头从后面转动着，小林洋介总算看清了少年的模样。
他的心里咯噔一下——
因为那个少年，就是零。
或者说，跟他一模一样。
而在他的身后，一些机械体正在进行着繁忙的施工。
屏幕再次变黑。
重新回到了主界面。
……
纳尼？！
这是发生了什么？
虽然是个Bad Ending，不过也让小林洋介感到头皮发麻。
因为这个Bad Ending的既视感非常的强，让他产生了一些眩晕感。
……
小林洋介思考了一下，然后载入存档。
他要再打一次最后的主脑。
……
经过了大概30多次左右的失败，小林洋介总算干掉了主脑。
这个跟零长得一模一样的复制体，身体下血水汩汩而出。
就在这个时候，小林洋介发现了一丝不对。
他原本以为这个复制体是由主脑控制的机械体，虽然外面看起来是个人类，但是实际上应该是个机械。
没有想到居然真的是个碳基生命。
只不过他之前是穿戴着高级机械装备，所以才会那么难打。
就在这时，画面中出现了一个箭头提示，提醒小林洋介可以摧毁那个被玻璃罩子笼罩着的主脑了。
于是小林洋介操作着男主，走向了控制台。
“你如果摧毁了我，那么人类就真的回不去了。”复制体捂着胸口说。
控制台上，也出现了同样的话：
“相信我，我可以帮助你们回去。”
“那你为什么不这么做呢？”男主问到，“假如你真的能做到的话，那么你应该早就可以实现了吧？”
“我……我不能干涉自由的意志。”复制体低着头。
“唔……”男主再次犹豫起来。
“那你却能伤害我们？”
“不……那些都不是真实，”主脑继续回复到，“我在尝试让你们用自我的意志回去。所以，请你相信我……”
复制体已经完全死亡，剩下的只有控制台上面闪烁着的主脑的话。
男主静静地思考着，过了很久他才走过去，伸出手来按下了控制台上面的摧毁按钮。
……
这次，游戏进入了另外一个结局——
随着主脑的被破坏，整个世界的轰鸣声突然停止。
似乎所有的机器都停了下来。
男主乘坐着电梯回到了地面，机械们都已经陷入瘫痪当中，人们奔走相告，互相激动地拥抱在了一起。
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