“终极力量”事件中，另一个平行世界的英雄队伍“至高中队”（Squadron Supreme，是正史至高中队的另一个版本）认为他们的世界遭到终极世界的侵害，与终极世界几乎所有的主要英雄开战。最后他们发现主要罪魁是弗瑞，于是他被流放到至高中队世界，他的位置被卡罗尔·丹佛斯继承。而后至高中队世界的威力公主扎达则来到了终极世界。
终极战队第三辑中，战队从天盾总部搬到了史塔克提供的宅邸；托尔结识了一个憧憬超级英雄的凡人女孩，赋予了她一部分力量，代号女武神（Valkiria）；一股神秘势力把钢铁侠和黑寡妇的私情录像在网上传播，很快绯红女巫又被刺杀，来历不明的毒液袭击了宅邸，万磁王的兄弟会夺走了绯红女巫的尸体，终极战队追踪到蛮荒之地，同时发现自己遭到皮姆开发的机器人奥创暗算，后者试图用根据他们的DNA设计的机器人取代这些英雄。虽然奥创被打败，但无人发现幕后主使是毁灭博士。
终极通牒：万磁王在失去孩子后决心对人类发起总攻，通过逆转地球磁极引发巨大的自然灾害，许多英雄与平民一起死亡。纽约被洪水淹没，美国队长和女武神溺水，灵魂坠入海拉的地狱，托尔甘愿自己留在地狱，让两人还阳。皮姆目睹黄蜂侠死亡，自己在保卫天盾总部时与敌方人弹同归于尽；剩余的英雄聚集起来挑战万磁王，后者发觉变种人不是自然进化的下一阶段后，甘愿就死。这次事件期间，弗瑞回到了终极世界。
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