商船上的13名船员遇害之后尸体被发现，国内警方查看尸体后认为这一案件疑点很多，于是与国内公安与老挝、缅甸、泰国三国警方组成了专案组。
而中国警方率先将案件破获，通过艰苦卓绝的斗争，最终将犯罪分子抓获。
《湄公河行动》影片是以糯康被抓捕做为结束的，但现实版中，央视在2013年3月1日“直播”了喏康死刑的过程，虽然最后并未直播行刑画面，但也看到毒枭凶犯的虚弱、很怕死。
电影中的惊险和激战，相信和当时真实发生的时候差别不大，因为剧组特地邀请了当时的队长担任顾问一职。
如果要将情节细分，大致可以分为两段，第一段是乔装卧底、第二段是武装抓捕，两段都有精彩绝伦的动作戏，观众在惊心动魄之余能体会到演员舍身忘我表演的惊险。
全片节奏很快，对于“湄公河行动”的前情基本没有太多铺垫，不了解案件情况的观众甚至会感到应接不暇。
林超贤拍港式警匪枪战可谓驾轻就熟，这一次有万重山的大笔资金支持，以及官方背景的尺度特批，再加上把场景从香港闹市转移到更加神秘恐怖的金三角地区，让巷战、追逐都上了一个层次，更加凌厉而大气。
电影中的场面调度和摄影、音响，都具备相当高度的工业水准。在闹市飞车爆炸，以及毫不分说的一刀扎进人质的脖子，都是先前内地电影甚至港片罕见的尺度，仔细一想，毕竟是在国外，可以肆意一点。
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